复旦大学目前开设本科专业76个，包括：
中国语言文学系的汉语言文学、汉语言
外国语言文学学院的英语、翻译、德语、日语、朝鲜语、俄语、法语
新闻学院的新闻学、广播电视新闻学、传播学、广告学
历史学系的历史学
旅游学系的旅游管理
文物与博物馆学系的文物与博物馆学
哲学学院的哲学、宗教学
社会发展与公共政策学院的社会学、社会工作、心理学
国际关系与公共事务学院的政治学与行政学、行政管理、国际政治、思想政治与教育
法学院的法学；
经济学院的经济学、经济学（数理经济方向拔尖项目）、经济学专业国际项目（UIPE）、国际经济与贸易（国际经济学）、金融学、财政学、保险学
数学科学学院的数学与应用数学、信息与计算科学
物理学系的物理学
大气科学与海洋系的大气科学
核科学与技术系的核工程与核技术
化学系的化学、应用化学、能源化学
高分子科学系的高分子材料与工程
信息科学与工程学院的智能科学与技术（卓越班，智能系统方向）、智能科学与技术（卓越班）、光电信息类（卓越班）、电子信息科学与技术、通信工程、电气工程及其自动化、生物医学工程、光电信息科学与工程
微电子学院的微电子科学与工程（卓越班）、微电子科学与工程
材料科学系的材料化学、材料物理、电子科学与技术
航空航天系的飞行器设计与工程、理论与应用力学
生命科学学院的生物科学、生物技术、生态学
环境科学与工程系的环境科学
大数据学院的数据科学与大数据技术
计算机科学技术学院的计算机科学与技术、信息安全
软件学院的软件工程（卓越班）、软件工程
国家保密学院的保密管理、保密技术
管理学院的工商管理（战略、国际商务、人力资源管理方向）、市场营销、财务管理（金融工程方向）、会计学、管理科学（供应链方向）、信息管理与信息系统（电子商务方向）、统计学
医学院的临床医学（8年制本博连读）（卓越医生计划）、临床医学（5年制）（卓越医生计划）、基础医学（拔尖人才培养计划）、法医学
公共卫生学院的预防医学（5年制）、公共事业管理
药学院的药学
护理学院的护理学、护理学（助产士方向）
工程与应用技术研究院的物理电子学、计算机应用技术、生物医学工程、电子信息（专业学位）、机械（专业学位）